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蘇曉泉教授課題組用大數(shù)據(jù)引擎繪制全球微生物組轉(zhuǎn)化網(wǎng)絡

作者:    來源:計算機科學技術學院      編輯:郭書君   日期:2021年07月15日 23:33   閱讀:1

新聞網(wǎng)訊 在自然界的各種生態(tài)系統(tǒng)中,微生物以群落(即“微生物組”)的形式廣泛存在并相互作用,從而深刻地塑造著地球生物圈的功能。然而,微生物組多樣性的形成和演變過程一直懸而未決。近日,我校計算機科學技術學院蘇曉泉教授課題組提出了一種基于大數(shù)據(jù)搜索的理論模型,從多個尺度探索不同生態(tài)系統(tǒng)之間微生物組的內(nèi)在關聯(lián)與演化規(guī)律。該研究于7月13日發(fā)表于mSystems(美國微生物學會會刊,SCI IF=6.50)。

基于該理論模型,研究人員運用前期開發(fā)的微生物組搜索引擎(MSE; http://mse.ac.cn)和超過17萬例樣本,計算和繪制了首個全球性的“微生物組相互轉(zhuǎn)化網(wǎng)絡”,從而刻畫出不同生態(tài)系統(tǒng)中微生物組最可能的演化途徑,對于重構歷史上曾經(jīng)存在過的微生物組,或設計全新的微生物組,具有重要的指導意義。該研究是與中科院青島能源所及加州大學圣地亞哥分校等機構合作完成,并得到了國家自然科學基金、中國科學院微生物組計劃等項目的支持。

論文鏈接:https://journals.asm.org/doi/10.1128/mSystems.00394-21


    

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